Gnp -> gnp; Gnm -> gnm, etc for mlisp happiness
authorGary King <gwking@metabang.com>
Tue, 21 Mar 2006 14:51:05 +0000 (09:51 -0500)
committerGary King <gwking@metabang.com>
Tue, 21 Mar 2006 14:51:05 +0000 (09:51 -0500)
darcs-hash:20060321145105-3cc5d-1a4a755ec40859ad3a253db3c8edf6513843de81.gz

dev/api.lisp
dev/graph-algorithms.lisp
dev/graph-generation.lisp
dev/graph.lisp
dev/graphviz/graphviz-support.lisp

index 42dac55..5e0f672 100644 (file)
@@ -312,12 +312,12 @@ For more information about DOT file format, search the web for 'DOTTY' and
 
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
 
-(defgeneric generate-Gnm (generator graph n m &key)
+(defgeneric generate-gnm (generator graph n m &key)
   (:documentation "Generate a 'classic' random graph G(n, m) with n vertexes and m edges."))
 
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
 
-(defgeneric generate-Gnp (generator graph n p &key)
+(defgeneric generate-gnp (generator graph n p &key)
   (:documentation  "Generate the Erd\"os-R\'enyi random graph G\(n, p\). I.e., a graph with n vertexes where
 each possible edge appears with probability p. This implementation is from Efficient Generation
 of Large Random Networks \(see batagelj-generation-2005 in doab\)."))
index 9ee37a8..6230047 100644 (file)
@@ -4,7 +4,7 @@
 ;;;
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
 
-(defstruct (vertex-datum (:conc-name "NODE-") (:type list))
+(defstruct (vertex-datum (:conc-name node-) (:type list))
   (color nil)
   (depth most-positive-fixnum)
   (parent nil))
index 90f1f5d..1638596 100644 (file)
@@ -1,8 +1,8 @@
 (in-package metabang.graph)
 
 (eval-when (:compile-toplevel :load-toplevel :execute)
-  (export '(generate-Gnp
-            generate-Gnm
+  (export '(generate-gnp
+            generate-gnm
             generate-undirected-graph-via-assortativity-matrix
             generate-undirected-graph-via-vertex-probabilities
             generate-multi-group-graph-fixed
 
 
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
-;;; generate-Gnp
+;;; generate-gnp
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
 
-(defmethod generate-Gnp (generator (graph-class symbol) n p &key (label 'identity))
-  (generate-Gnp
+(defmethod generate-gnp (generator (graph-class symbol) n p &key (label 'identity))
+  (generate-gnp
    generator (make-instance graph-class) n p :label label))
 
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
 
-(defmethod generate-Gnp (generator (graph basic-graph) n p &key (label 'identity))
+(defmethod generate-gnp (generator (graph basic-graph) n p &key (label 'identity))
   (let ((v 1)
         (w -1)
         (log-1-p (log (- 1 p))))
     graph))
 
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
-;;; generate-Gnm
+;;; generate-gnm
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
 
-(defmethod generate-Gnm (generator (graph-class symbol) n p &key (label 'identity))
-  (generate-Gnm
+(defmethod generate-gnm (generator (graph-class symbol) n p &key (label 'identity))
+  (generate-gnm
    generator (make-instance graph-class) n p :label label))
 
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
 
-(defmethod generate-Gnm (generator (graph basic-graph) n m &key (label 'identity))
+(defmethod generate-gnm (generator (graph basic-graph) n m &key (label 'identity))
   (let ((max-edge-index (1- (combination-count n 2))))
     (assert (<= m max-edge-index))
     #+Ignore
index 8a7bd94..e0c5aee 100644 (file)
@@ -198,7 +198,7 @@ something is putting something on the vertexes plist's
 
 (defmethod print-object ((graph basic-graph) stream)
   (print-unreadable-object (graph stream :type t :identity t)
-    (format stream "~A" (size graph))))
+    (format stream "[~A,~A]" (size graph) (edge-count graph))))
 
 
 ;;; ---------------------------------------------------------------------------
index 63cd048..26a35bf 100644 (file)
@@ -87,9 +87,11 @@ This file contains the stuff that does not depend on cl-graphviz.
         (iterate-vertexes 
          g
          (lambda (v)
+          ;(spy v)
            (iterate-edges
             v
             (lambda (e)
+             ;(spy e (undirected-edge-p e) (item-at-1 edges e))
               (when (and (undirected-edge-p e)
                          (not (item-at-1 edges e)))
                 (setf (item-at-1 edges e) t)